Jusqu'aux années cinquante, la recherche préhistorique au Liban est dominée par les savants de la compagnie de Jésus. Le matériel qu'ils ont accumulé au cours d'un siècle d'activités sur le terrain constitue actuellement l'unique collection de référence pour les recherches. Ce patrimoine a été confié à la Faculté des Lettres et des Sciences humaines de l'USJ. Un projet, élaboré en1988, a abouti dans un premier temps à la création d'un Centre de recherches, et en juin 2000, à la réalisation du Musée de Préhistoire libanaise.