La FMD s'aligne sur la vision, la mission et les valeurs de l'Université Saint-Joseph de Beyrouth dans la perspective de la Vision 2025. La mission de la FMD est de « former des chirurgiens-dentistes hautement qualifiés, pleinement conscients de leurs responsabilités sociales et éthiques. Elle contribue également au développement de la profession et de son influence en articulant la recherche expérimentale et clinique, ainsi qu'en participant activement à l'avancement de la santé bucco-dentaire au niveau national. »

La FMD est également positionnée comme une référence nationale et régionale en matière de formation de dentistes de haut niveau reconnus pour leur excellence, leur éthique et leur conscience professionnelle, ainsi que leur engagement social à travers le développement de la recherche, la qualité de l'enseignement et le service à la communauté. Ce centre d'excellence occupe aujourd'hui, tout comme par le passé, une place centrale dans la mission de la Faculté. De plus, la FMD de l'USJ est le siège permanent de la Société des facultés dentaires arabes, et son doyen en est le secrétaire général permanent, démontrant le rôle de leader fort de la Faculté dans la région. Elle aspire à être reconnue comme un centre d'excellence dans l'éducation, la recherche, et la promotion de la santé bucco-dentaire non seulement au Liban, mais aussi dans la région du Moyen-Orient.