Les études doctorales proposent une formation à la recherche, aboutissant à l’obtention du diplôme de doctorat et du grade de docteur d’université.
Couvrant la presque totalité des disciplines enseignées au sein de l’Université, les 5 Ecoles doctorales fournissent un encadrement académique de haut niveau ainsi qu’une préparation à l’insertion professionnelle.
Chacune des 5 écoles doctorales de l’USJ associe plusieurs équipes de recherche qui prennent en charge la formation par la recherche des doctorants.
Elles assurent une continuité depuis les sciences fondamentales jusqu’aux sciences appliquées, mettant l’accent sur l’interdisciplinarité et l’ouverture internationale, et offrent un encadrement scientifique de haut niveau ainsi qu'une préparation à l'insertion professionnelle.
Les documents ci-dessous consistent à uniformiser les documents relatifs aux thèses de doctorat en conformité aux exigences du décret-loi 10068/2013.
 1 - Proposition de jury
 1 - Proposition de jury 2 - Rapport après soutenance
 2 - Rapport après soutenance 3 -  Procès verbal
 3 -  Procès verbal 4 - Guide Pour la rédaction et la présentation des thèses
 4 - Guide Pour la rédaction et la présentation des thèses 5 -  Page de garde
 5 -  Page de garde 6 - Formulaire d'enregistrement des thèses
 6 - Formulaire d'enregistrement des thèses 7 - Avenant à la thèse
 7 - Avenant à la thèse 8 - Charte des thèses
 8 - Charte des thèses 9 - Convention cotutelle internationale
 9 - Convention cotutelle internationale 10 - Convention de co-direction
 10 - Convention de co-direction 11 - Avenant changement directeur
 11 - Avenant changement directeur 12 - Avenant changement co-directeur
 12 - Avenant changement co-directeur 13 - Soutenance de thèses
 13 - Soutenance de thèses