Biocontrôle de la production de mycotoxines par des microorganismes antagonistes : approches moléculaires

Description :

Les toxines produites par certains champignons filamenteux représentent un risque sérieux pour la qualité sanitaire des aliments et entraînent des pertes économiques importantes. Actuellement, une trentaine de mycotoxines sont considérées comme préoccupantes pour la santé de l’homme ou des animaux et sept sont soumises à une réglementation. Parmi celles-ci, l’aflatoxine B1 produite par le genre Aspergillus est un des plus puissants cancérigènes connu d’origine naturel. Pour lutter contre le développement des moisissures, on a recours essentiellement à des fongicides. Cependant, ces produits phytosanitaires ou leurs résidus peuvent se retrouver dans les aliments traités et avoir des conséquences néfastes sur la santé des consommateurs et sur l’environnement. Dans un souci de réduction des intrants chimiques -exemple du plan Ecophyto2 en France qui a pour objectif de réduire de 50% l’emploi des produits phytosanitaires d’ici 2025-, des alternatives telles que des traitements physiques, chimiques ou le biocontrôle se sont développées pour limiter la croissance du champignon et/ou la production des toxines. Dans le cadre de ce projet de thèse, nous envisageons d’inhiber la production de mycotoxines, les aflatoxines, la patuline et l’ochratoxine A, sans toutefois affecter la croissance fongique, Aspergillus flavus, Penicillium expansum et Aspergillus carbonarius, respectivement, afin de ne pas perturber l’équilibre écologique des substrats. Ainsi, nous rechercherons des microorganismes antagonistes comme les levures issues de la flore naturelle des substrats (pomme, raisin, céréales) de même que des molécules ou des extraits bioactifs synthétisés par des microalgues ou des cyanobactéries. Nous chercherons également à comprendre les mécanismes d’action des inhibiteurs potentiels de la toxinogenèse par des approches de transcriptomique. Les résultats obtenus pourraient trouver une application en agriculture, traitement in planta, ou lors du stockage des denrées alimentaires.