Profil protéomique et caractérisation de souches de Salmonella spp. impliquées dans des intoxications alimentaires par différentes approches biochimiques et moléculaires et développement des modèles de la croissance bactérienne par intégration des profils temps température.

Description :

Les modèles de microbiologie prévisionnelle actuellement disponibles sous forme de logiciels prêts à l'emploi donnent la possibilité de calculer le potentiel de croissance d'un microorganisme retenu dans un aliment pour une température constante dans le temps. De ce fait ces logiciels ne sont donc pas adaptés lorsque la température varie. Aussi, pour y remédier, nous utiliserons des critères quantitatifs élaborés à partir des modèles de base de la microbiologie prévisionnelle et permettant de traduire des profils temps-température en terme de croissance microbienne potentielle. Cette approche, présentée ici dans le contexte de l'analyse des dangers, est également applicable dans le domaine de l'appréciation des risques La cinétique de croissance microbienne se décompose en plusieurs phases distinctes. Sa modélisation requiert l’emploi d’au moins deux modèles mathématiques : - un modèle primaire, décrivant l’évolution du nombre de bactéries au cours du temps, ce qui définit un taux de croissance (appelé µ) décrivant la vitesse de multiplication exponentielle des bactéries dans ces conditions - un modèle secondaire, relatif à l’influence de l’environnement physico-chimique - dans notre cas, la température - sur le taux de croissance µ. Le taux de croissance étant très influencé par la température, le modèle secondaire choisi pour décrire cet effet sera différent selon la plage des températures enregistrées. De plus, dans cette étude, le sérotypage de nos souches collectées sera effectué, pour identifier les sérotypes de Salmonella les plus répandues dans les produits alimentaires au Liban. Ce travail va nous permettre d’acquérir des informations précieuses sur des protéines non caractéristiques qui peuvent être des marqueurs moléculaires des souches de salmonelles. Un typage moléculaire des sérotypes identifiés sera effectué par une et/ou les techniques suivantes : le séquençage, l’AFLP, PFGE, RAPD, PCR-RFLP, MLST et la MLVA. La détection et la caractérisation des gènes de pathogénicité (SPI-1 à 5 et SPI-23), codant pour les facteurs de virulence impliqués dans l’adhérence et l’invasion de l'hôte et du gène fimH, connu comme marqueur de l'hôte seront aussi investiguer.