تضمّ رئاسة جامعة القدّيس يوسف مجموعة من الدوائر المختلفة التي تؤمّن سير عملها
| دائرة إعلام وتوجيه الطلاّب |
| دائرة الصيانة والحفاظ على الأبنية |
| دائرة المنشورات والاتّصالات |
| دائرة تدقيق ومراقبة الموجودات |
| دائرة تكنولوجيا المعلومات |
| مكتب خرّيجي جامعة القديس يوسف في بيروت |
| مكتب مندوب رئيس الجامعة لضمان الجودة |
| مؤسّسة جامعة القدّيس يوسف في بيروت |
| نيابة الرئاسة لشؤون البحث العلميّ |
| نيابة الرئاسة للشؤون الإداريّة |
| نيابة الرئاسة للشؤون الأكاديميّة |
| نيابة رئاسة الجامعة للعلاقات الدوليّة |
|
